Există două aspecte de luat în considerare: fructele depozitate îndelung și resturile de fructe. Muștele de fructe pot ieși din fructele depozitate îndelung dacă adulții depun ouă pe suprafața fructului, care eclozează în larve și apoi se dezvoltă în adulți în timp. Resturile de fructe pot atrage și muștele de fructe dacă conțin drojdie, pe care o pot simți de la distanță. În plus, muștele de fructe pot pătrunde cu ușurință în case prin găuri mici din paravanele ferestrelor. Pentru a controla muștele de fructe, capcanele cu momeală și plăcile lipicioase pot fi eficiente.
